Степан родился и вырос в селе Барышево Новосибирского района. В 2003 году пошёл в первый класс МБОУ-Барышевская СШ № 9. Всегда старался и хорошо учился. Принимал активное участие во всех школьных мероприятиях, конкурсах и показывал хорошие результаты. В 2008 году принял участие в международном игровом конкурсе по английскому языку и хорошо выступил. Но мечтой Степана остаётся поездка в Африку. Это совсем не случайно, что на СВО его позывной был «Африка». В 2007 году по окончании начальной школы на память от своей первой учительницы Ильиной Надежды Васильевны получил медаль «Самому смелому» с надписью «Нам всем известно с давних пор: Ты можешь дать врагу отпор!»
В 2012 году Степан окончил 9 классов и поступил в Новосибирский электромеханический колледж по специальности «Техническая эксплуатация подъёмно-транспортных машин и оборудования».
9 сентября 2023 года ушёл добровольцем. Героически выполняя свой долг на передовой при обороне г. Кременная, Степан 24 ноября получил ранения, от которых 28 ноября 2023 года скончался в госпитале г. Донецка.
Варников Степан Владимирович за мужество и героизм, проявленные в ходе выполнения задач специальной военной операции, награждён орденом Мужества посмертно.